RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	LRBA	P50851	2863 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H2BK	O60814	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	OR2J3	O76001	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	TRGC1	P0CF51	173 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HOXA5	P20719	270 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HNF1A	P20823	631 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H2BO	P23527	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H2BB	P33778	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H2BD	P58876	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H2BC	P62807	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	SMUG1	Q53HV7	270 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	RASL11A	Q6T310	242 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501		Q9H3A6	140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ACACB	O00763	2458 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF98	A6NK75	572 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ATP6V0E1	O15342	81 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF253	O75346	499 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	BRI3	O95415	125 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	TCRA	P04437	139 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	MYCNOS	P40205	109 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	RHOG	P84095	191 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ATP5G2	Q06055	141 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	C15orf32	Q32M92	178 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	MORN5	Q5VZ52	161 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	FRZB	Q92765	325 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	OR2T8	A6NH00	312 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501		K7EN84	100 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	NDP	Q00604	133 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	CT83	Q5H943	113 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	OR5R1	Q8NH85	324 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	USMG5	Q96IX5	58 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	GNB4	Q9HAV0	340 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF492	Q9P255	531 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
PNKP-231	ENST00000640501		A0A0G2JLM5	398 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501	XKRY2	A2RUG3	117 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501	FAM231B	A6NCW3	169 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501		A8MWL6	223 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501		P01737	135 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501	HLA-DQA1	P01909	254 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501	PRB1	P04280	392 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501	IGF1	P05019	195 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501	CTSG	P08311	255 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501	CT45A10	P0DMU9	189 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501	IGLC2	P0DOY2	106 aa		6.52	□□□□□ -1.37
PNKP-231	ENST00000640501	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms