RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575171.1

NXN-208, Transcript of nucleoredoxin, human

TSL 2

Gene NXN, Length 544 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NXN-208	ENST00000575171	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IGSF23	A1L1A6	192 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171		H0YIZ8	118 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	MPC2	O95563	127 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TOMM40	O96008	361 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IL4	P05112	153 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	FABP1	P07148	127 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	RD3L	P0DJH9	198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	MAL	P21145	153 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CBLN1	P23435	193 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	P2RY1	P47900	373 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	DLK1	P80370	383 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ZNF90	Q03938	601 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	OR2F1	Q13607	317 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	BTNL8	Q6UX41	500 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	MARC2	Q969Z3	335 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	MBD2	Q9UBB5	411 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171		K7EMT4	169 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	IGLV1-51	P01701	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	PSG1	P11464	419 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	SULT1A1	P50225	295 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	LYZ	P61626	148 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	LCN12	Q6JVE5	192 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	THAP8	Q8NA92	274 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	THAP6	Q8TBB0	222 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	PRR25	Q96S07	402 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	METTL26	Q96S19	204 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	TRGV9	Q99603	122 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	MLX	Q9UH92	298 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	GP9	P14770	177 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	NPPC	P23582	126 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	BMI1	P35226	326 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	HBG1	P69891	147 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	HBG2	P69892	147 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	GUCA2B	Q16661	112 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	RNF126	Q9BV68	326 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	MLST8	Q9BVC4	326 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	GGACT	Q9BVM4	153 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	SMPX	Q9UHP9	88 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	FNDC10	F2Z333	226 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	CHEK1	O14757	476 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24	2e-6	■■■□□ 14.6
NXN-208	ENST00000575171	C8orf88	P0DMB2	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	S100A11	P31949	105 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	BAX	Q07812	192 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	FGL1	Q08830	312 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	CLINT1	Q14677	625 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	ASB13	Q8WXK3	278 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	DKK2	Q9UBU2	259 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	RABAC1	Q9UI14	185 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171		A0A1W2PS18	150 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	ORM2	P19652	201 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NXN-208	ENST00000575171	FHL2	Q14192	279 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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