RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM144Q7Z5S9 345 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BPIFCQ8NFQ6 507 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSENENQ9NZ42 101 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D24Q9ULP9 559 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 X6R8D5 127 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALMS1Q8TCU4 4167 aa12.21□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BP45 60 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOCS3O14543 225 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLA2G10O15496 165 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MITD1Q8WV92 249 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PMS2P5A8MQ11 134 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf94C9JXX5 98 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ISLRO14498 428 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MEOX2P50222 304 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCTAP57738 103 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAS2R30P59541 319 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKR1C1Q04828 323 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR82Q96P67 336 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC5AQ9NY25 188 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF98A6NK75 572 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FNDC10F2Z333 226 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LYRM1O43325 122 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GALR1P47211 349 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAX9P55771 341 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00052Q96N35 136 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSSCA1O60232 199 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ORM2P19652 201 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLK1P80370 383 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GDF5OSQ5U4N7 250 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LGALS9CQ6DKI2 356 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00299Q6ZSB3 139 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR1B1Q8NGR6 318 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2CD4CQ8TF44 421 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM147Q9BVK8 224 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPVFQ9HCQ7 196 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XCL2Q9UBD3 114 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSC22D2O75157 780 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCRBP04435 133 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL5P05113 134 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLP1P60201 277 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SELENOTP62341 195 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR10P1Q8NGE3 313 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEU1Q99519 415 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C20orf85Q9H1P6 137 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A32Q9H2D1 315 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A22Q9H936 323 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GSKIPQ9P0R6 139 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMCO3A2RU48 225 aa12.15□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EBLN2Q6P2I7 272 aa12.15□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C16orf92Q96LL3 132 aa12.15□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RSG1Q9BU20 258 aa12.15□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC32Q9BV29 185 aa12.15□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPRMQ9NS64 109 aa12.15□□□□□ -0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 K7EPK0 472 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCGB1D2O95969 90 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METTL15P1P0C7V9 234 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLA-DMBP28068 263 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFB1P60022 68 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAP2BP61225 183 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 S100A7AQ86SG5 101 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C17orf77Q96MU5 243 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GGACTQ9BVM4 153 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0J9YX75 114 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C7orf66A4D0T2 115 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HYPMO75409 117 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCNKO75909 580 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV3-20P01619 116 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBPP02686 304 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSG9Q00887 426 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF846Q147U1 533 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEPPQ6URK8 271 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4B1Q8NGF8 309 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MGAT4CQ9UBM8 478 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF24Q9Y225 148 aa12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms