RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR2B	P41595	481 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH3B2	P48448	385 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA13	P48723	471 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	DLK1	P80370	383 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC32	Q5I0X7	151 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF709	Q8N972	641 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	ACY3	Q96HD9	319 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	NACA	E9PAV3	2078 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1-5	P01602	117 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB3	P49720	205 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM78B	Q5VT40	261 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SSX7	Q7RTT5	188 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	FCGR1B	Q92637	280 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK11	Q9UBX7	282 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	LYRM9	A8MSI8	78 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511		F6UB75	175 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5G1	P05496	136 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5G3	P48201	142 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	UCP3	P55916	312 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SPART	Q8N0X7	666 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPB3	Q92617	1050 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD1	Q96SE0	405 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	VCX3B	Q9H321	246 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9H8V8	135 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	TOMM40	O96008	361 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	RCVRN	P35243	200 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGP	P57054	158 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	GABARAPL2	P60520	117 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SPCS3	P61009	180 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF79	Q15937	498 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	FRZB	Q92765	325 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53RK	Q96S44	253 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	RPRM	Q9NS64	109 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	COPZ2	Q9P299	210 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	NXPH3	O95157	252 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	INS	P01308	110 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PSG1	P11464	419 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	BSX	Q3C1V8	233 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SP6	Q3SY56	376 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	NOXA1	Q86UR1	476 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	DOK5	Q9P104	306 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0J9YX75	114 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP92	A6NM28	416 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ISLR	O14498	428 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511		P0C879	139 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PAX9	P55771	341 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	RND3	P61587	244 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	LYZ	P61626	148 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf83	Q53S99	150 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511		Q5VSD8	79 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR146	Q96CH1	333 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CBY3	A6NI87	242 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PRM2	P04554	102 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP1	P07148	127 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	HTN1	P15515	57 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	B2M	P61769	119 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5I1	Q13606	314 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	FCN2	Q15485	313 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52E5	Q8NH55	327 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	GPX8	Q8TED1	209 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511	UHRF2	Q96PU4	802 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JRQ6	117 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R2Z0	102 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21

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