RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495292.1

FAM107B-227, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-227	ENST00000495292	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	RBKS	Q9H477	322 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-227	ENST00000495292	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	PITX3	O75364	302 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	PSG1	P11464	419 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ID1	P41134	155 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	PSMB3	P49720	205 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	MEOX2	P50222	304 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	GAMT	Q14353	236 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	TRGV9	Q99603	122 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292		H3BMM0	161 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	DEFB4A	O15263	64 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	SFT2D2	O95562	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	NEU1	Q99519	415 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292		V9GYH0	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292		X6R8D5	127 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	IGLL5	B9A064	214 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ISLR	O14498	428 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	SYNGR2	O43760	224 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	AMBP	P02760	352 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	INPP1	P49441	399 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	LYZ	P61626	148 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF79	Q15937	498 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	GPR82	Q96P67	336 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	CENPX	A8MT69	81 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	SOCS3	O14543	225 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	IAPP	P10997	89 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	GALR1	P47211	349 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	PAX9	P55771	341 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF90	Q03938	601 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292		Q6ZTC4	211 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-227	ENST00000495292	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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