RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC32Q9BV29 185 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 CLEC5AQ9NY25 188 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 PMS2P5A8MQ11 134 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 H3BMM0 161 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 CCNKO75909 580 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 METTL15P1P0C7V9 234 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 ORM2P19652 201 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00052Q96N35 136 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 NUDT15Q9NV35 164 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC45A2Q9UMX9 530 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
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SH3BP4-211ENST00000493436 HLA-DRB4P13762 266 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 PSMB3P49720 205 aa12.16□□□□□ -0.46
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SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa12.16□□□□□ -0.46
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SH3BP4-211ENST00000493436 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8NAQ8 132 aa12.16□□□□□ -0.46
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SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM147Q9BVK8 224 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 MFFQ9GZY8 342 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC25A22Q9H936 323 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF98A6NK75 572 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP4-211ENST00000493436 SOCS3O14543 225 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP4-211ENST00000493436 IL5P05113 134 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF846Q147U1 533 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 GDF5OSQ5U4N7 250 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP4-211ENST00000493436 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 OR10P1Q8NGE3 313 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-211ENST00000493436 SEC22CQ9BRL7 303 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.14□□□□□ -0.47
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SH3BP4-211ENST00000493436 ISLRO14498 428 aa12.14□□□□□ -0.47
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SH3BP4-211ENST00000493436 DOK5Q9P104 306 aa12.14□□□□□ -0.47
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SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D24Q9ULP9 559 aa12.14□□□□□ -0.47
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SH3BP4-211ENST00000493436 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 C7orf66A4D0T2 115 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 C5orf51A6NDU8 294 aa12.13□□□□□ -0.47
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SH3BP4-211ENST00000493436 MEOX2P50222 304 aa12.13□□□□□ -0.47
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SH3BP4-211ENST00000493436 C16orf92Q96LL3 132 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 RSG1Q9BU20 258 aa12.13□□□□□ -0.47
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SH3BP4-211ENST00000493436 LY6G6CO95867 125 aa12.12□□□□□ -0.47
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SH3BP4-211ENST00000493436 SELENOTP62341 195 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 VAMP2P63027 116 aa12.12□□□□□ -0.47
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SH3BP4-211ENST00000493436 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 HIGD1AQ9Y241 93 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ALMS1Q8TCU4 4167 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 H3BRN7 92 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 HYPMO75409 117 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 OR5G3P0C626 314 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 FXYD7P58549 80 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 PLP1P60201 277 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ARL16Q0P5N6 197 aa12.11□□□□□ -0.47
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