RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CELA1Q9UNI1 258 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 WRBO00258 174 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SYNGR2O43760 224 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SFT2D2O95562 160 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 GALR1P47211 349 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 INPP1P49441 399 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 MEOX2P50222 304 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 EMP1P54849 157 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 C12orf74Q32Q52 190 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 TRIM63Q969Q1 353 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 ISLRO14498 428 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 HOXB5P09067 269 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 C16orf92Q96LL3 132 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 NEU1Q99519 415 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.51□□□□□ -0.09
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ACTB-212ENST00000484841 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 PSG9Q00887 426 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 AKR1C1Q04828 323 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R1AQ13522 171 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 THAP8Q8NA92 274 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A22Q9H936 323 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 RFNGQ9Y644 331 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 AMBPP02760 352 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 P0DMU3 169 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 FAM231AP0DMU4 169 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 FAM231CP0DMU5 169 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 DEFB1P60022 68 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 TMEM147Q9BVK8 224 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 ORM2P19652 201 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 V9GYH0 126 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SOCS3O14543 225 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 HBE1P02100 147 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 ZNF79Q15937 498 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 GPR82Q96P67 336 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SMCO3A2RU48 225 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 ZNF98A6NK75 572 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 PAX9P55771 341 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 FAM78BQ5VT40 261 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 RSG1Q9BU20 258 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-212ENST00000484841 F6UB75 175 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 H3BP45 60 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 IFNA21P01568 189 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 TRIQKQ629K1 86 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 DOK5Q9P104 306 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 A0A0J9YX75 114 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 RAP2BP61225 183 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 FGL1Q08830 312 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 ZNF709Q8N972 641 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 PSENENQ9NZ42 101 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 IL5P05113 134 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 RRN3P1Q2M238 152 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 S100A7AQ86SG5 101 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 CCDC190Q86UF4 302 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 C9orf170A2RU37 121 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 CENPXA8MT69 81 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 PRSS46E5RG02 174 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 HTN3P15516 51 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 FAM210BQ96KR6 192 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 DKK2Q9UBU2 259 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 ADAP1O75689 374 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.41□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 C20orf173Q96LM9 149 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-212ENST00000484841 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.41□□□□□ -0.1
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