RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484046.1

TM4SF1-AS1-201, TM4SF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TM4SF1-AS1, Length 488 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 K7EQD1 137 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ISLRO14498 428 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PRAF2O60831 178 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC22A5O76082 557 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGKV1-17P01599 117 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SRIP30626 198 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CRYBA4P53673 196 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TAS2R31P59538 309 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CROCCP2Q86T23 111 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM230Q96A57 120 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GINS4Q9BRT9 223 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RPRMQ9NS64 109 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPATA2Q9UM82 520 aa3.36□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FAM231BA6NCW3 169 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM235A6NFC5 223 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SNURFLB1AK76 121 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 H7BYZ3 331 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 H7C1H1 209 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLN5O75503 358 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FAM107AO95990 144 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HLA-DQB1P01920 261 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CDK1P06493 297 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CFC1BP0CG36 223 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 UBBP0CG47 229 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NQO2P16083 231 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SMIM29Q86T20 159 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BLNKQ8WV28 456 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM56Q96MV1 263 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CKLFQ9UBR5 152 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.35□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IFITM10A6NMD0 228 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HPRT1P00492 218 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGHV3-30P01768 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGHV3-33P01772 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FCGR3AP08637 254 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM50BP56557 158 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 QRFPP83859 136 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ARL16Q0P5N6 197 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLAQ13239 276 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF846Q147U1 533 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPCS2Q15005 226 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 XAF1Q6GPH4 301 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CFAP161Q6P656 301 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DHFR2Q86XF0 187 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C7orf33Q8WU49 177 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IL22RA2Q969J5 263 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NRBF2Q96F24 287 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LPAR5Q9H1C0 372 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KCNK15Q9H427 330 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FUT9Q9Y231 359 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.34□□□□□ -1.87
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 A0A087WYN8 130 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TAAR5O14804 337 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LALBAP00709 142 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DAPP51397 102 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TIGITQ495A1 244 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 Q499Y3 187 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCDC190Q86UF4 302 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.33□□□□□ -1.88
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms