RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	AMT	P48728	403 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	SGK494	Q96LW2	274 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	VWC2L	B2RUY7	222 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	TIMM23	O14925	209 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF492	Q9P255	531 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1B0GXF2	115 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	OR2J3	O76001	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058		H3BTX0	84 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	RNF224	P0DH78	156 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	LYZ	P61626	148 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	PLGLA	Q15195	96 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	PMCH	P20382	165 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	KRTDAP	P60985	99 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	CT83	Q5H943	113 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	NIT1	Q86X76	327 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	OTOR	Q9NRC9	128 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	CCL21	O00585	134 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	RAB4A	P20338	218 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	HTR1D	P28221	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	CFHR4	Q92496	578 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	VAMP8	Q9BV40	100 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058		K7EIM0	57 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	DIRC3	C9JPN6	131 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058		M0R143	59 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	CDSN	Q15517	529 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	MMD	Q15546	238 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058		A8MWL6	223 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	LY6H	O94772	140 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	CNIH1	O95406	144 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	ZZEF1	O43149	2961 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	NBR2	O15453	112 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFA3	O95167	84 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	TCF24	Q7RTU0	167 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058		Q86TA4	180 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	NPB	Q8NG41	125 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058		P01737	135 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	ARF6	P62330	175 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	GTSF1	Q8WW33	167 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	IGLV2-11	P01706	119 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	CAMP	P49913	170 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058		A6NNC1	897 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058		M0R1W7	72 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	C3orf79	P0CE67	100 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	CEACAM3	P40198	252 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	HBB	P68871	147 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	NHLH1	Q02575	133 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058		H3BRN7	92 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	CTRL	P40313	264 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	ABCA1	O95477	2261 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TOM1-210	ENST00000449058	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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