RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP5S	Q99766	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRBA	P50851	2863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A087WX48	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		A6NDX4	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNFSF12	O43508	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GCG	P01275	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD24	P25063	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	AMT	P48728	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PMVK	Q15126	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	DOK5	Q9P104	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	F8	P00451	2351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1B0GU03	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		H0YJW9	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BTX0	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LYRM1	O43325	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPR137B	O60478	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPN	P16150	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	P2RY1	P47900	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLINT1	Q14677	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLGLA	Q15195	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	MMD	Q15546	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF5	Q99942	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RETN	Q9HD89	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CENPE	Q02224	2701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	MPDU1	O75352	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PROP1	O75360	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	HRAS	P01112	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLPI	P03973	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CRYGD	P07320	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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