RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLL5B9A064 214 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TCL1BO95988 128 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 SCN3AQ9NY46 2000 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BTX0 84 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EM74 188 aa5.46□□□□□ -1.54
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RABGEF1-202ENST00000380828 BMFQ96LC9 184 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ODF3Q96PU9 254 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV27A0A087WT01 109 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TCRAP04437 139 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP5G3P48201 142 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXL14Q8N1E6 418 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 RTTNQ86VV8 2226 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 DEDDO75618 318 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 SS18Q15532 418 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TECTAO75443 2155 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 GCSHP23434 173 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ERVK-16P61578 105 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM92Q6UXU6 159 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 AAED1Q7RTV5 226 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 CEND1Q8N111 149 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2A5Q96R48 311 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF7Q9UBF6 113 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 FRYQ5TBA9 3013 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 UNC119Q13432 240 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TEN1Q86WV5 123 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF799Q96GE5 643 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 U3KQE9 123 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GVT2 93 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 SPINK4O60575 86 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 CD40P25942 277 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS27P42677 84 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 PDFQ9HBH1 243 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 PMVKQ15126 192 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM187Q14656 261 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 APOOQ9BUR5 198 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFHX3Q15911 3703 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRBP23467 1997 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1D-16P01601 117 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 EFNA4P52798 201 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC29Q8WV35 223 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 NUS1Q96E22 293 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 DPM2O94777 84 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGEF1-202ENST00000380828 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 MMD2Q8IY49 270 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 A1L4Q6 167 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 GRPP07492 148 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYGAP11844 174 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 EMDP50402 254 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51H1Q8NH63 302 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNG5Q9UF02 275 aa5.42□□□□□ -1.54
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