RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SPINK4O60575 86 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PGA4P0DJD7 388 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PGA5P0DJD9 388 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ANOS1P23352 680 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OPRM1P35372 400 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PRR3P79522 188 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SLC38A11Q08AI6 406 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CCSMST1Q4G0I0 132 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 LCN8Q6JVE9 175 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SFXN4Q6P4A7 337 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF620Q6ZNG0 422 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 RNF165Q6ZSG1 346 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP18Q8NEJ0 188 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 KLHDC9Q8NEP7 349 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGDIGQ99819 225 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SMIM7Q9BQ49 75 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CHCHD5Q9BSY4 110 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM243Q9BU79 118 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR1A1Q9P1Q5 309 aa1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FREM3P0C091 2139 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 NAV2Q8IVL1 2488 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 OR5B21A6NL26 309 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 H3BP45 60 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 M0R1X1 148 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 OR7C2O60412 319 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFB1O75438 58 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 LEPROTL1O95214 131 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 CST2P09228 141 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 ESDP10768 282 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 VDAC1P21796 283 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 S100A11P31949 105 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 PFN3P60673 137 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 SPANXN1Q5VSR9 72 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 NAXDQ8IW45 347 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 OR2AE1Q8NHA4 323 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 Q96M85 177 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 MS4A4EQ96PG1 132 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 RNF126Q9BV68 326 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 KLK15Q9H2R5 256 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 RNF7Q9UBF6 113 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 DOCK11Q5JSL3 2073 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 FREM1Q5H8C1 2179 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 HMSDA8MTL9 139 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 GPR75O95800 540 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 ASAH2BP0C7U1 165 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 MPC1LP0DKB6 136 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 CT45A10P0DMU9 189 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 PSG1P11464 419 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF32P17041 273 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 RPL12P30050 165 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 TSPOP30536 169 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2G1P62253 170 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF90Q03938 601 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 COX17Q14061 63 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 FZD2Q14332 565 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D28Q2M2D7 210 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 MPV17LQ2QL34 196 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF626Q68DY1 528 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 IGFL2Q6UWQ7 119 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 SLC16A11Q8NCK7 471 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf52Q8NHV5 167 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 PATE1Q8WXA2 126 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 TM4SF18Q96CE8 201 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 FCRL1Q96LA6 429 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 MIEN1Q9BRT3 115 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 TLNRD1Q9H1K6 362 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 OR5V1Q9UGF6 321 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 FUT9Q9Y231 359 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF835Q9Y2P0 537 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 TIMM9Q9Y5J7 89 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 FN1P02751 2386 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 MYO9AB2RTY4 2548 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PS18 150 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 CLDN24A6NM45 220 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 H0YGG7 62 aa1.96□□□□□ -2.1
CCSAP-202ENST00000366686 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms