RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 GGNQ86UU5 652 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 GGTLC1Q9BX51 225 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 DOCK3Q8IZD9 2030 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 MYOD1P15172 320 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 OCIAD2Q56VL3 154 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 ERG28Q9UKR5 140 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 GAGE12BA1L429 117 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 ACTL10Q5JWF8 245 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 RNF182Q8N6D2 247 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 CFHR1Q03591 330 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM256Q8N2U0 113 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 PPBPP02775 128 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 THBDP07204 575 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM42Q69YG0 159 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087X0K7 114 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GW64 132 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 HGFACQ04756 655 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 PLNP26678 52 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 ORMDL2Q53FV1 153 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 STHQ8IWL8 128 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 CITED1Q99966 193 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 GREB1Q4ZG55 1949 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM105Q8N8V8 129 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 MLNRO43193 412 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 FOXF2Q12947 444 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 hDV102S1A0JD36 115 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 SPINK8P0C7L1 97 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 HTN3P15516 51 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 MGST2Q99735 147 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 GUSBP1Q15486 140 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 CLPSP04118 112 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 RFNGQ9Y644 331 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 WFDC12Q8WWY7 111 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 F2Z2F3 143 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM249Q2WGJ8 235 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf55Q5SWW7 151 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 GTSCR1Q86UQ5 136 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 CRIPAKQ8N1N5 446 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 SMPXQ9UHP9 88 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 NPIPB5A8MRT5 1133 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 PRR31Q5SQ13 230 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf79P0CE67 100 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 MALP21145 153 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 LCN12Q6JVE5 192 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF562Q6V9R5 426 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF14Q92956 283 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 CD28P10747 220 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF6BO95407 300 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV1-5P01602 117 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 SELLP14151 372 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 PAX8Q06710 450 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 NMSQ5H8A3 153 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 GGTLC3B5MD39 225 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 M0R2P5 195 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 SRD5A1P18405 259 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 KIR3DS1Q14943 382 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 EDA2RQ9HAV5 297 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 COX11Q9Y6N1 276 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf63A6NC05 138 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 SRRM5B3KS81 715 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 PSPNO60542 156 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 CD177Q8N6Q3 437 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS22Q9GZN4 317 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV3A0A0B4J244 114 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM200BQ69YZ2 307 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 KLHDC3Q9BQ90 382 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 GHRHP01286 108 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 LINC01551Q86U37 167 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 PMS2P5A8MQ11 134 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf24Q7Z6I8 188 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 OVOL1O14753 267 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 RNF144BQ7Z419 303 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 AGMATQ9BSE5 352 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 SCRT1Q9BWW7 348 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A20O43772 301 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 ASCL4Q6XD76 172 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRM-211ENST00000580170 A8MWP6 167 aa17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83 ms