RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	HTR2B	P41595	481 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	BCAP31	P51572	246 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RND2	P52198	227 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RAB32	Q13637	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	BSX	Q3C1V8	233 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C2orf83	Q53S99	150 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C2orf50	Q96LR7	162 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688		K7EMT4	169 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688		L7N2F9	121 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PRAF2	O60831	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	MED6	O75586	246 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SLC25A6	P12236	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CXCL3	P19876	107 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CAV2	P51636	162 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	MFAP4	P55083	255 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PAX9	P55771	341 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	H2BFS	P57053	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	VAMP2	P63027	116 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ID3	Q02535	119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OR2F1	Q13607	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	FCN2	Q15485	313 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ATP6V0B	Q99437	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RARRES2	Q99969	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CSTL1	Q9H114	145 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C7orf66	A4D0T2	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C11orf94	C9JXX5	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CORT	O00230	105 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CST7	O76096	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CTSG	P08311	255 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RAB11A	P62491	216 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	AKR1C1	Q04828	323 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ARL16	Q0P5N6	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OXA1L	Q15070	435 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SLC35E1	Q96K37	410 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	MED28	Q9H204	178 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688		U3KQ87	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	IGSF23	A1L1A6	192 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ZFP92	A6NM28	416 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688		H0YIZ8	118 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SMLR1	H3BR10	107 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	NDUFA4	O00483	81 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CLN5	O75503	358 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	GHRH	P01286	108 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CD5	P06127	495 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OR10J1	P30954	320 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	NPBWR1	P48145	328 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PRR20E	P86478	221 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PRR20C	P86479	221 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PRR20D	P86480	221 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PRR20B	P86481	221 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PRR20A	P86496	221 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ZNF90	Q03938	601 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	GAMT	Q14353	236 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SMIM8	Q96KF7	97 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	HRH4	Q9H3N8	390 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	FBXL17	Q9UF56	701 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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