RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 STPG3Q8N7X2 389 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TMED6Q8WW62 240 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 RAX2Q96IS3 184 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 CITED1Q99966 193 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 VSIRQ9H7M9 311 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 NUDT19A8MXV4 375 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 MPDU1O75352 247 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TOMM40O96008 361 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SLURP1P55000 103 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 B2MP61769 119 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 PATE2Q6UY27 113 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 ATP6V0BQ99437 205 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 DOK5Q9P104 306 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 RD3LP0DJH9 198 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 FHITP49789 147 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 RAB2AP61019 212 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 LYZP61626 148 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 ZNF616Q08AN1 781 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 FHL3Q13643 280 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 MORN5Q5VZ52 161 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SSX7Q7RTT5 188 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 OR11H1Q8NG94 326 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 LINC01619G3V211 115 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 CCL24O00175 119 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 NDUFA4O00483 81 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TSPAN15O95858 294 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 IL4P05112 153 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SEC11BP0C7V7 166 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 C4BPBP20851 252 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SYNJ2BPP57105 145 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 PLP1P60201 277 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SELENOTP62341 195 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 RAB31Q13636 194 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 ZNF726P1Q15940 193 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 RPEL1Q2QD12 228 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 FAM209BQ5JX69 171 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 ZNF709Q8N972 641 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 RNF125Q96EQ8 232 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 UHRF2Q96PU4 802 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 RPRMQ9NS64 109 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 RYR3Q15413 4870 aa6.21□□□□□ -1.41
CS-216ENST00000549221 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 ORM2P19652 201 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 TM4SF20Q53R12 229 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 TEX261Q6UWH6 196 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 GPHB5Q86YW7 130 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 Q8WTZ3 238 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-216ENST00000549221 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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