RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 PERPQ96FX8 193 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 FAM210BQ96KR6 192 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 BRS3P32247 399 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 GALR1P47211 349 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 NDPQ00604 133 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 Q8N9W7 124 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 OR5B12Q96R08 314 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 PAXXQ9BUH6 204 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 OR51M1Q9H341 326 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 C1RLQ9NZP8 487 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 C5orf52A6NGY3 159 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R2P9O14990 202 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 NPFFO15130 113 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 TGOLN2O43493 480 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 HYPMO75409 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 S100A6P06703 90 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 PYYP10082 97 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 ORM2P19652 201 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 S100PP25815 95 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 CRYBB3P26998 211 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5J2P56134 94 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 OR5T1Q8NG75 326 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 OCC1Q8TAD7 63 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 FXYD5Q96DB9 178 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 ZANQ9Y493 2812 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 HLA-DRB1P01911 266 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 PSG1P11464 419 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 MBD6Q96DN6 1003 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 SFRP2Q96HF1 295 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 ACANP16112 2415 aa6.46□□□□□ -1.37
PDE4D-208ENST00000502484 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HELTA6NFD8 242 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV1-17P01599 117 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TIGITQ495A1 244 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TEX38Q6PEX7 206 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 NECAP1Q8NC96 275 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IMMP2LQ96T52 175 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 K7EN84 100 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2CO00762 179 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 FABP1P07148 127 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TRGC2P03986 189 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 GP9P14770 177 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 PAX1P15863 534 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 MYCNOSP40205 109 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PPQ1 181 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 AP4M1O00189 453 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 PHOX2AO14813 284 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TOMM40O96008 361 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 RD3LP0DJH9 198 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 GNG4P50150 75 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 LYZP61626 148 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 FOXL1Q12952 345 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 CENPWQ5EE01 88 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF329Q86UD4 541 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 THYN1Q9P016 225 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV1-69P01742 117 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TYMSP04818 313 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 HNF1AP20823 631 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 MFAP4P55083 255 aa6.44□□□□□ -1.38
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