RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YPEL2Q96QA6 119 aa0□□□□□ -2.41
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR51I1Q9H343 314 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LY96Q9Y6Y9 160 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGF2RP11717 2491 aa-0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAF1LQ8IZX4 1826 aa-0.01□□□□□ -2.41
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C17orf112F2Z3M2 114 aa-0.02□□□□□ -2.41
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-0.02□□□□□ -2.41
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CT55Q8WUE5 264 aa-0.03□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PBOV1Q9GZY1 135 aa-0.03□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSTPIP2Q9H939 334 aa-0.03□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAS2R7Q9NYW3 318 aa-0.03□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52A1Q9UKL2 312 aa-0.03□□□□□ -2.41
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KNTC1P50748 2209 aa-0.03□□□□□ -2.41
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAV3A0A0B4J244 114 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM9A6NGZ8 99 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C5orf67F2Z3F1 127 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIMM17BO60830 172 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GADD45GO95257 159 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL5P46777 297 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCL2L15Q5TBC7 163 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZQY7 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR51D1Q8NGF3 324 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLAMF6Q96DU3 332 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRADC1Q9BSG0 188 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS29Q9UBQ0 182 aa-0.04□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.05□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR4C46A6NHA9 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 E7EUB6 86 aa-0.05□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2J2O76002 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10J4P0C629 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXCL8P10145 99 aa-0.05□□□□□ -2.42
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