RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLC1	P0CG04	106 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	PET100	P0DJ07	73 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	RD3L	P0DJH9	198 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	EDN2	P20800	178 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	NPPC	P23582	126 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	CAV2	P51636	162 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL26	Q96S19	204 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	MED28	Q9H204	178 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	ALG5	Q9Y673	324 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PS18	150 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	SMCO3	A2RU48	225 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	SIX6	O95475	246 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1C1	Q04828	323 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB32	Q13637	225 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	SMPX	Q9UHP9	88 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4C46	A6NHA9	309 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2C	O00762	179 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	TOMM40	O96008	361 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-17	P01599	117 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A7	P31151	101 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	PAX9	P55771	341 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	STX12	Q86Y82	276 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	GGACT	Q9BVM4	153 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424		E5RGE8	158 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	FNDC10	F2Z333	226 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	HBG1	P69891	147 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	HBG2	P69892	147 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	DLK1	P80370	383 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	IL15RA	Q13261	267 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGV9	Q99603	122 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	DEDD	O75618	318 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	PAFAH1B2	P68402	229 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZWC4	215 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	CHEK1	O14757	476 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	IL4	P05112	153 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	PSG1	P11464	419 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A11	P31949	105 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	APOC4	P55056	127 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB31	Q13636	194 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	LILRB2	Q8N423	598 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	THAP8	Q8NA92	274 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	RABAC1	Q9UI14	185 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS46	E5RG02	174 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	SULT1A1	P50225	295 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	H2BFS	P57053	126 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	OXA1L	Q15070	435 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A7A	Q86SG5	101 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB13	Q8WXK3	278 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYBB3	P26998	211 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RY1	P47900	373 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	SELENOT	P62341	195 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	TEPP	Q6URK8	271 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	VSIR	Q9H7M9	311 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	CST7	O76096	145 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF90	Q03938	601 aa		12.83	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 252.9 ms