RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488013.1

HDLBP-242, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-242ENST00000488013 CD28P10747 220 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 BMI1P35226 326 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 B2MP61769 119 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 RPEL1Q2QD12 228 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 PFDN5Q99471 154 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 RNF2Q99496 336 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 MGST2Q99735 147 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF747Q9BV97 191 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-242ENST00000488013 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 LINC01619G3V211 115 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 IGHV3-23P01764 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 SPP1P10451 314 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 ATP6V0CP27449 155 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 ADMP35318 185 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 MYCNOSP40205 109 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 PLP1P60201 277 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 TIGITQ495A1 244 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 LCE2CQ5TA81 110 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 STPG3Q8N7X2 389 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 C3orf56Q8N813 242 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 ST8SIA2Q92186 375 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 OR4F4Q96R69 305 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 CITED1Q99966 193 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 ATRQ13535 2644 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 K7EMT4 169 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 LGALS9O00182 355 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 HYPMO75409 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 YIF1AO95070 293 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 IFNA7P01567 189 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 LINC00869P0C866 280 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 PSG1P11464 419 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 DEFA5Q01523 94 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF90Q03938 601 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 OR11H1Q8NG94 326 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 S4R3C0 116 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 A0A1W2PS18 150 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 CCL24O00175 119 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 COX7A2P2O60397 106 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 M6PRP20645 277 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 REC114Q7Z4M0 266 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 C1QL4Q86Z23 238 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 MARC2Q969Z3 335 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 RNF125Q96EQ8 232 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 OR5B12Q96R08 314 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 METTL26Q96S19 204 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 RSG1Q9BU20 258 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 PEMTQ9UBM1 199 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 NF1P21359 2839 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 PPP5D1E7EU14 171 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 IL4P05112 153 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 CD5P06127 495 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 NPPCP23582 126 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 FHL3Q13643 280 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 MIC13Q5XKP0 118 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 RNF141Q8WVD5 230 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 RABAC1Q9UI14 185 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 A0A087WW49 117 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-242ENST00000488013 A0A1W2PPV4 95 aa8.48□□□□□ -1.05
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