RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-211	ENST00000469733	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	TAS2R60	P59551	318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	IFITM10	A6NMD0	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	SLC17A3	O00476	420 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	PEX7	O00628	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	GCG	P01275	180 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	GP9	P14770	177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	S100A2	P29034	98 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	MYCNOS	P40205	109 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	SAA4	P35542	130 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	NDP	Q00604	133 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	CCL19	Q99731	98 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733		V9GYV3	84 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	BRS3	P32247	399 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	AJUBA	Q96IF1	538 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	OSTC	Q9NRP0	149 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	ISLR	O14498	428 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	PGP	A6NDG6	321 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	TOMM40	O96008	361 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733		Q8N9W7	124 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	FAM168A	Q92567	244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	NPFF	O15130	113 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	GNG7	O60262	68 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	MFAP4	P55083	255 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	GNG5	P63218	68 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	THYN1	Q9P016	225 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FAAP20-211	ENST00000469733	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	BAGE2	Q86Y30	109 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733		S4R3C0	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	UBE2G1	P62253	170 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	RNF125	Q96EQ8	232 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733		Q9H3A6	140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733		H3BTX0	84 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	NDUFS8	O00217	210 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	IL4	P05112	153 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-211	ENST00000469733	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.2 ms