RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 APRG1Q8IVJ8 170 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GWJ7 208 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 KNCNA6PVL3 124 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SFT2D2O95562 160 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV1-47P01700 117 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-53P01767 116 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZS46 218 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 OR5AN1Q8NGI8 311 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 OR1P1Q8NH06 330 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SUN5Q8TC36 379 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RNF125Q96EQ8 232 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 BET1LQ9NYM9 111 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 E5RGE8 158 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 M0R036 132 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 MMP9P14780 707 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 UCP1P25874 307 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 S100A11P31949 105 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CSTL1Q9H114 145 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RBKSQ9H477 322 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF702PQ9H963 129 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SLC45A2Q9UMX9 530 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 GPR132Q9UNW8 380 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00473A8K010 186 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CBLN1P23435 193 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 AKR1C3P42330 323 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 PROK1P58294 105 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CFHR3Q02985 330 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 BSNQ9UPA5 3926 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf170A2RU37 121 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CGB3P0DN86 165 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 OR2C3Q8N628 320 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 VGLL1Q99990 258 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM74A4Q5TZK3 123 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 HCFC1P51610 2035 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 XKRY2A2RUG3 117 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 IGF1P05019 195 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 MUC21Q5SSG8 566 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 PAXXQ9BUH6 204 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TREM1Q9NP99 234 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf61A6NNL5 157 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf65H3BRN8 121 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CLN5O75503 358 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SMLR1H3BR10 107 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 H3BUA1 57 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CD7P09564 240 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CCL18P55774 89 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 MIC13Q5XKP0 118 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZPA2 131 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZS49 121 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TP53RKQ96S44 253 aa3.47□□□□□ -1.85
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