RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	PLA2G10	O15496	165 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF737	O75373	536 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	MGMT	P16455	207 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	CRISP2	P16562	243 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	HTR1D	P28221	377 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	TALDO1	P37837	337 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	GRK1	Q15835	563 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RGS21	Q2M5E4	152 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAB22A	Q9UL26	194 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	TENM3	Q9P273	2699 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	GABARAP	H6UMI1	98 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	SULT1C2	O00338	296 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	TOR1A	O14656	332 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	PTTG1	O95997	202 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	HAND1	O96004	215 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGHV3-7	P01780	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	UBB	P0CG47	229 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	BRS3	P32247	399 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	DYNLT3	P51808	116 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	CLDN12	P56749	244 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAB25	P57735	213 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	DEFA1	P59665	94 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	DEFA3	P59666	94 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	AES	Q08117	197 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	PSG5	Q15238	335 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	KISS1	Q15726	138 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAB11B	Q15907	218 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	TCF23	Q7RTU1	214 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931		Q8N402	240 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	PXT1	Q8NFP0	134 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	IL22RA2	Q969J5	263 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	HES4	Q9HCC6	221 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	DIABLO	Q9NR28	239 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A1B0GVG6	124 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	LEUTX	A8MZ59	168 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	ORC5	O43913	435 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF861P	O60384	105 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	CA11	O75493	328 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RBP4	P02753	201 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	PRKACA	P17612	351 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	PRKACB	P22694	351 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	CDK2	P24941	298 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	NFYB	P25208	207 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	HRH1	P35367	487 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	RBP2	P50120	134 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	TAS2R20	P59543	309 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPR176	Q14439	515 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	HES1	Q14469	280 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	PYDC2	Q56P42	97 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR52W1	Q6IF63	320 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR52E5	Q8NH55	327 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	SUN5	Q8TC36	379 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPX8	Q8TED1	209 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	BORCS8	Q96FH0	119 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPACA5	Q96QH8	159 aa		3.79	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms