RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	OR4A16	Q8NH70	328 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	ST8SIA2	Q92186	375 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	IL22RA2	Q969J5	263 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	GPR146	Q96CH1	333 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	GINS3	Q9BRX5	216 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	SFT2D2	O95562	160 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	AKR1C4	P17516	323 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TCTA	P57738	103 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	LILRB2	Q8N423	598 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MUC1-222	ENST00000610468	PITX3	O75364	302 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TCRB	P04435	133 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	IFNA4	P05014	189 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	NPBWR1	P48145	328 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PRR20E	P86478	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PRR20C	P86479	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PRR20D	P86480	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PRR20B	P86481	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PRR20A	P86496	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	SLC35G3	Q8N808	338 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	FBXL17	Q9UF56	701 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0B4J2A0	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GU03	582 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	ST8SIA3	O43173	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	DEFB131A	P59861	70 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468		Q8NAQ8	132 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	OR4E1	P0C645	316 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	DHRS2	Q13268	280 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM16L	Q309B1	348 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	LEMD1	Q68G75	181 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	FAM219A	Q8IW50	185 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	CENPX	A8MT69	81 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	CORT	O00230	105 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	DEFB4A	O15263	64 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM50A	O95807	157 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	SNCA	P37840	140 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	RGS21	Q2M5E4	152 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	BSX	Q3C1V8	233 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	SPINK9	Q5DT21	86 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468		K7EQG2	157 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	NPPC	P23582	126 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	CRYBB3	P26998	211 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	INPP1	P49441	399 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	DEFA1	P59665	94 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	DEFA3	P59666	94 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	STH	Q8IWL8	128 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	LGI3	Q8N145	548 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	OR4X1	Q8NH49	305 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	MITD1	Q8WV92	249 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1W2PS18	150 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	CLN5	O75503	358 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79

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