RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.09□□□□□ -1.59
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SMAD4-212ENST00000591126 FANCMQ8IYD8 2048 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.07□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 LDLRAD4O15165 306 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 MALP21145 153 aa5.06□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 MFAP2P55001 183 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 ICAM4Q14773 271 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 J3QRE1 110 aa5.06□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 EMP1P54849 157 aa5.06□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF329Q86UD4 541 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 BSXQ3C1V8 233 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 SIRPDQ9H106 197 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 A0A1W2PRE2 83 aa5.06□□□□□ -1.6
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