RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	TMEM213	A2RRL7	107 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688		K7EIM0	57 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	SSNA1	O43805	119 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	CCNK	O75909	580 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	IFNA10	P01566	189 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	IFNA21	P01568	189 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	C8orf88	P0DMB2	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	OPRK1	P41145	380 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	S100A10	P60903	97 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	KLK9	Q2XQG4	91 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	LRTM2	Q8N967	370 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	RNF183	Q96D59	192 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	CXorf58	Q96LI9	332 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	MFF	Q9GZY8	342 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	MLX	Q9UH92	298 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	ALG5	Q9Y673	324 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688		F8W735	103 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688		I3L2K1	104 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PITX3	O75364	302 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	IFNA4	P05014	189 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CLEC3B	P05452	202 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	NPY1R	P25929	384 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OR1P1	Q8NH06	330 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C15orf62	A8K5M9	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	TSPAN4	O14817	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	TGOLN2	O43493	480 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SYNGR2	O43760	224 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	DEDD	O75618	318 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	TMEM50A	O95807	157 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PTTG1	O95997	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	IL5	P05113	134 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RGS21	Q2M5E4	152 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	DEFB135	Q30KP9	77 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	AARD	Q4LEZ3	155 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	BTNL8	Q6UX41	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CADM3	Q8N126	398 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ZNF114	Q8NC26	417 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OR52E5	Q8NH55	327 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ACY3	Q96HD9	319 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	THYN1	Q9P016	225 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	RYR2	Q92736	4967 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	SMCO3	A2RU48	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	OR4C46	A6NHA9	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688		K7EPK0	472 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	CYB5B	O43169	146 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	GNG7	O60262	68 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	YIF1A	O95070	293 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-233	ENST00000552688	ADM	P35318	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.9 ms