RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BAIAP2Q9UQB8 552 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASB4Q9Y574 426 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF24Q5T7B8 1368 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0D9SG52 128 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C3orf84H3BNL1 204 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 J3QQQ9 107 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHBGP04278 402 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AQP4P55087 323 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPL26P61254 145 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SS18Q15532 418 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFT20Q8IY31 132 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM86AQ8N2M4 240 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR4E2Q8NGC2 313 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPTC7Q8NI37 304 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPDR1Q9UM22 224 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLX4Q8IY92 1834 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ODAMA1E959 279 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEIS3P1A6NDR6 274 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR51F1A6NGY5 319 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GGCTO75223 188 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HTR1AP08908 422 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHOGP84095 191 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HES1Q14469 280 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDUFA5Q16718 116 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AAED1Q7RTV5 226 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM35BQ8NCS4 154 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CANT1Q8WVQ1 401 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AQP3Q92482 292 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CARD19Q96LW7 228 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC115Q96NT0 180 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 YPEL2Q96QA6 119 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRPM6Q9BX84 2022 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLIT2O94813 1529 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLCD2A6NGC4 264 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLPSP04118 112 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCGB1A1P11684 91 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC38A11Q08AI6 406 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAF9Q16594 264 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RTL8BQ17RB0 113 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HCP5Q6MZN7 132 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THEM6Q8WUY1 208 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BORCS8Q96FH0 119 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRADC1Q9BSG0 188 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RTL8AQ9BWD3 113 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ECM29Q5VYK3 1845 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0G2JQZ4 141 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARPC5O15511 151 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDUFB3O43676 98 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CXCL1P09341 107 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 METTL15P1P0C7V9 234 aa2.5□□□□□ -2.01
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 DYNLT3P51808 116 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMBIM6P55061 237 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MSMO1Q15800 293 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C22orf39Q6P5X5 142 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDZD9Q8IXQ8 264 aa2.5□□□□□ -2.01
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TEX37Q96LM6 180 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TECPR2O15040 1411 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYH3P11055 1940 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PMP2P02689 132 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COX6A1P12074 109 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NNATQ16517 81 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q6ZQT0 140 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q6ZTI0 123 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR8B3Q8NGG8 313 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAFIPQ8WZ33 124 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ISOC1Q96CN7 298 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSPB9Q9BQS6 159 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPCDR1Q9BY65 106 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM126AQ9H061 195 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RIC1Q4ADV7 1423 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLXNB1O43157 2135 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPRSQ13332 1948 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa2.48□□□□□ -2.01
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