RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482660.1

EML4-208, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 4, human

TSL 4

Gene EML4, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML4-208	ENST00000482660	C2orf83	Q53S99	150 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	GLMP	Q8WWB7	406 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660		X6R8D5	127 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		12.85	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	HELT	A6NFD8	242 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	GABARAP	H6UMI1	98 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	SLC25A4	P12235	298 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	HLA-DMB	P28068	263 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	RND2	P52198	227 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	DHRS2	Q13268	280 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660		Q8WTZ3	238 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	NAA60	Q9H7X0	242 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	CACNG5	Q9UF02	275 aa		12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
EML4-208	ENST00000482660	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36	3e-8	■■□□□ 13.4
EML4-208	ENST00000482660	OR10J1	P30954	320 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	DHODH	Q02127	395 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	MEF2D	Q14814	521 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	GPR146	Q96CH1	333 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	RAB40C	Q96S21	281 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	SMIM18	P0DKX4	95 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	PSMG4	Q5JS54	123 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	GPR107	Q5VW38	600 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660		Q6ZTC4	211 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	HERC2	O95714	4834 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	DISC1	C4P0D8	188 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	NXPH3	O95157	252 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	IL4	P05112	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	NPY1R	P25929	384 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	NPIPB3	Q92617	1050 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	GPR132	Q9UNW8	380 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	RGS5	O15539	181 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	BUB3	O43684	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	NMS	Q5H8A3	153 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	NOXA1	Q86UR1	476 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	NRN1	Q9NPD7	142 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	CELA1	Q9UNI1	258 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	CTDSP2	O14595	271 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	TOMM40	O96008	361 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	AKAIN1	P0CW23	69 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	RD3L	P0DJH9	198 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	IL22RA2	Q969J5	263 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	ACY3	Q96HD9	319 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	RNF126	Q9BV68	326 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EML4-208	ENST00000482660		H3BMM0	161 aa		12.77	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		12.77	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		12.77	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		12.77	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	PRRT1	Q99946	306 aa		12.77	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	XCL2	Q9UBD3	114 aa		12.77	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		12.76	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	CTDSPL	O15194	276 aa		12.76	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	AMBP	P02760	352 aa		12.76	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	PSG1	P11464	419 aa		12.76	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	C12orf74	Q32Q52	190 aa		12.76	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		12.76	□□□□□ -0.37
EML4-208	ENST00000482660	PRR13	Q9NZ81	148 aa		12.76	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.7 ms