RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ISLRO14498 428 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 CRYBB3P26998 211 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 MYCNOSP40205 109 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 CENPWQ5EE01 88 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM12Q96EX1 92 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 PERPQ96FX8 193 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 V9GYV3 84 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 C22orf46C9J442 243 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 OR5T1Q8NG75 326 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 PAXXQ9BUH6 204 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0U1RQK1 487 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF320A2RRD8 509 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFA3O95167 84 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV2-8P01709 118 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 CEACAM3P40198 252 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 LGALS4P56470 323 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 COX19Q49B96 90 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 FXYD5Q96DB9 178 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 XKRY2A2RUG3 117 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 CNTFRP26992 372 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF90Q03938 601 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 RPEL1Q2QD12 228 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 TIGITQ495A1 244 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 MORN5Q5VZ52 161 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 CFHR4Q92496 578 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 OOSP1A8MZH6 123 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 PRTN3P24158 256 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 HTR1DP28221 377 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 OR5R1Q8NH85 324 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 DPM3Q9P2X0 92 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 POLEQ07864 2286 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF329Q86UD4 541 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 TNCP24821 2201 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 RNF224P0DH78 156 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 HCP5Q6MZN7 132 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 I3L2K1 104 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 REG1AP05451 166 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 FABP4P15090 132 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 COX7A1P24310 79 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 MISP3Q96FF7 219 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 AMBPP02760 352 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ERVFC1-1P60608 527 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 TIMM23O14925 209 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 NBR2O15453 112 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 HYPMO75409 117 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 FBXL15Q9H469 300 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 A6NNC1 897 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 PEX7O00628 323 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 MOSP00540 346 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 MT-ND6P03923 174 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 ESDP10768 282 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 CX3CL1P78423 397 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRF-212ENST00000477970 IGLC1P0CG04 106 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRF-212ENST00000477970 GP9P14770 177 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRF-212ENST00000477970 EBI3Q14213 229 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRF-212ENST00000477970 PYYP10082 97 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRF-212ENST00000477970 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRF-212ENST00000477970 WDR73Q6P4I2 378 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRF-212ENST00000477970 RASL11AQ6T310 242 aa9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.8 ms