RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471308.5

PCBP4-208, Transcript of poly(rC) binding protein 4, human

TSL 2

Gene PCBP4, Length 2,087 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP4-208	ENST00000471308	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	PERP	Q96FX8	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	CNTFR	P26992	372 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	OR5I1	Q13606	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	C22orf46	C9J442	243 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	PAX1	P15863	534 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	PYY	P10082	97 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	ADM	P35318	185 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	MFAP2	P55001	183 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	DLX1	P56177	255 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	COX19	Q49B96	90 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	C14orf144	Q96I85	54 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	MOS	P00540	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	PLP1	P60201	277 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	ZNF329	Q86UD4	541 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	MT-ND6	P03923	174 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	PKIA	P61925	76 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	TSTD3	H0UI37	97 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308		M0R1W7	72 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	PEX7	O00628	323 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	GZMB	P10144	247 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	CBLN1	P23435	193 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	CX3CL1	P78423	397 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PCBP4-208	ENST00000471308	HYPM	O75409	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	ORM2	P19652	201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	HTR1D	P28221	377 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	CEACAM3	P40198	252 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	NHLH1	Q02575	133 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	PLGLA	Q15195	96 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	MYCNOS	P40205	109 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	CDSN	Q15517	529 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	SNURFL	B1AK76	121 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	FCN1	O00602	326 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	SMIM12	Q96EX1	92 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	TIMM23	O14925	209 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	APELA	P0DMC3	54 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	IER3	P46695	156 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	FXYD3	Q14802	87 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	CRISP2	P16562	243 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	MMD	Q15546	238 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	BAGE2	Q86Y30	109 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	NBR2	O15453	112 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	ESD	P10768	282 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	GP9	P14770	177 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	DDT	P30046	118 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	UBE2G1	P62253	170 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308		I3L2K1	104 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	LY6H	O94772	140 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	CNIH1	O95406	144 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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