RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 BTF3L4Q96K17 158 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 NGBQ9NPG2 151 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 CRISP2P16562 243 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 NBL1P41271 181 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 BAGE3Q86Y29 109 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 BAGE2Q86Y30 109 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 FAM168AQ92567 244 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 MS4A10Q96PG2 267 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 A0A1W2PRD5 423 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 A0A1W2PRF3 423 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 A0A1W2PRM7 423 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 SERF1AO75920 110 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 TOX4O94842 621 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 NEU1Q99519 415 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
HPS3-202ENST00000460120 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 MFAP2P55001 183 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 C22orf46C9J442 243 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 CD24P25063 80 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 PSMB11A5LHX3 300 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 TCAPO15273 167 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 IGLV2-8P01709 118 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 FBXL15Q9H469 300 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 GCGP01275 180 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 RBPJQ06330 500 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 PLGLAQ15195 96 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 MUC15Q8N387 334 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 A0A1W2PRE2 83 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 ISLRO14498 428 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 LINC00310P59036 64 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 CDSNQ15517 529 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 BPIFB3P59826 476 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 PNKDQ8N490 385 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 LINC00311Q8N616 119 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 K7ENP7 123 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 SIAH2O43255 324 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 MC5RP33032 325 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 REC114Q7Z4M0 266 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 ZNF329Q86UD4 541 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 OR4A5Q8NH83 315 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 S4R3C0 116 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 IQCJQ1A5X6 159 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 B9A039 149 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 CORTO00230 105 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 Q6ZWC4 215 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 RPEQ96AT9 228 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 FXYD5Q96DB9 178 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 NAGKQ9UJ70 344 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 A8MWP6 167 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 PEX7O00628 323 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 CDKN1AP38936 164 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 TBX15Q96SF7 602 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 GNB4Q9HAV0 340 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS3-202ENST00000460120 PGPA6NDG6 321 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 CCL21O00585 134 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 TDRG1Q3Y452 100 aa14.52□□□□□ -0.09
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