RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	GADD45A	P24522	165 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	NPBWR1	P48145	328 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	FCN2	Q15485	313 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	HES5	Q5TA89	166 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	OR51H1	Q8NH63	302 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	TMEM56	Q96MV1	263 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		7.72	□□□□□ -1.17
CS-208	ENST00000547298	MYL12B	O14950	172 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	SSX5	O60225	188 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	ZNF79	Q15937	498 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	EREG	O14944	169 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	KRAS	P01116	189 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	PPY	P01298	95 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	ATP5G1	P05496	136 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	RAB6A	P20340	208 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	FCGR2C	P31995	323 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	G6PC	P35575	357 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	ATP5G3	P48201	142 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	CATR1	Q13166	79 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	CDNF	Q49AH0	187 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	HACD4	Q5VWC8	232 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	TMEM203	Q969S6	136 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298		V9GY05	133 aa		7.7	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	CBY3	A6NI87	242 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	IGKV1-17	P01599	117 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298		P0C879	139 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	ERVK-16	P61578	105 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	MLANA	Q16655	118 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	NRN1	Q9NPD7	142 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	PRND	Q9UKY0	176 aa		7.69	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	ATP8B1	O43520	1251 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	CLN5	O75503	358 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	SNAPC5	O75971	98 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	OXT	P01178	125 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	AZU1	P20160	251 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	LPAR6	P43657	344 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	OR10A3	P58181	314 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	PRCD	Q00LT1	54 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	AHSA2	Q719I0	299 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298		F6UB75	175 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	F2R	P25116	425 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	PSG9	Q00887	426 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	TIGIT	Q495A1	244 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	TPRA1	Q86W33	373 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	TMEM230	Q96A57	120 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	TMEM235	A6NFC5	223 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298		A8MTW9	85 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	EBAG9	O00559	213 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	SOCS3	O14543	225 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	BUB3	O43684	328 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	TSPO	P30536	169 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	RASSF2	P50749	326 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	PAX9	P55771	341 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	FXYD4	P59646	89 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	FAM78B	Q5VT40	261 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	AMTN	Q6UX39	209 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-208	ENST00000547298	OR4X1	Q8NH49	305 aa		7.66	□□□□□ -1.18

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