RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF1AP19438 455 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CD1BP29016 333 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 LINC01551Q86U37 167 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR4S2Q8NH73 311 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 COX11Q9Y6N1 276 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 FAM208BQ5VWN6 2430 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CR1LQ2VPA4 569 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR4F5Q8NH21 305 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR4F4Q96R69 305 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PAGE4O60829 102 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 IFNA1P01562 189 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MC5RP33032 325 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 DLX1P56177 255 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ADIRFQ15847 76 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MIC13Q5XKP0 118 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ACY3Q96HD9 319 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 hADV38S2A0JD32 116 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 J3QLI3 93 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR7C2O60412 319 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 LYNX1P0DP58 116 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 GNB2P62879 340 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SLAQ13239 276 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 LINC01560Q8TB33 94 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 DDB2Q92466 427 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 FCN3O75636 299 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PLAUP00749 431 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PSMB3P49720 205 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 KRTDAPP60985 99 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NIT1Q86X76 327 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM186Q96B77 213 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPV4 95 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SHISA9B4DS77 424 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.52e-8■■□□□ 14.4
HERC4-211ENST00000492996 CT45A6P0DMU7 189 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CT45A5P0DMU8 189 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CT45A7P0DMV0 189 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 THBS3P49746 956 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TREML4Q6UXN2 200 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MOB3BQ86TA1 216 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CHODLQ9H9P2 273 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ENY2Q9NPA8 101 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 E7EQL1 145 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TOX4O94842 621 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MT-CO2P00403 227 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CA2P00918 260 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SPATA45Q537H7 98 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 RAB9BQ9NP90 201 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CACNA1BQ00975 2339 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GUS0 222 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 C15orf61A6NNL5 157 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 B4DEV8 164 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM178BH3BS89 294 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 H7BYZ3 331 aa5.68□□□□□ -1.5
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