RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 OSTCQ9NRP0 149 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 PCTPQ9UKL6 214 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 ODF3BA8MYP8 253 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 H7C2G1 150 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 EMP1P54849 157 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 AGTRAPQ6RW13 159 aa3.25□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 GINS4Q9BRT9 223 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.25□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.25□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PNN7 141 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 C19orf84I3L1E1 186 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 TAX1BP3O14907 124 aa3.24□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1-16P04430 117 aa3.24□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8NDZ9 215 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPRSQ13332 1948 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0D9SEW6 157 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV3-19P01714 112 aa3.23□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 OGNP20774 298 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP12-2P59991 146 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa3.23□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 STAG3L4Q8TBR4 150 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 WFDC5Q8TCV5 224 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM106AQ96A25 262 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 LRTM1Q9HBL6 345 aa3.23□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 SCN9AQ15858 1988 aa3.23□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 SETD5Q9C0A6 1442 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 SCGB1A1P11684 91 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 NFYBP25208 207 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
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RABGGTB-209ENST00000473406 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 DCANP1Q8TF63 244 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 TVP23CQ96ET8 276 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 SLX4Q8IY92 1834 aa3.21□□□□□ -1.9
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RABGGTB-209ENST00000473406 SHROOM3Q8TF72 1996 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM212A6NML5 194 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 M0R378 163 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 FXYD2P54710 66 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF90Q03938 601 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.2□□□□□ -1.9
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RABGGTB-209ENST00000473406 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-209ENST00000473406 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.2□□□□□ -1.9
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RABGGTB-209ENST00000473406 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.2□□□□□ -1.9
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RABGGTB-209ENST00000473406 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.19□□□□□ -1.9
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RABGGTB-209ENST00000473406 S100A12P80511 92 aa3.19□□□□□ -1.9
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RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.19□□□□□ -1.9
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RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.19□□□□□ -1.9
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