RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	IFNA17	P01571	189 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV1-17	P01599	117 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	BMI1	P35226	326 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SNCA	P37840	140 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	NPBWR1	P48145	328 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TFPI2	P48307	235 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	MEF2D	Q14814	521 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TCF24	Q7RTU0	167 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM219A	Q8IW50	185 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM230	Q96A57	120 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SOST	Q9BQB4	213 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	NAA60	Q9H7X0	242 aa		8.8	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CORT	O00230	105 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CLN5	O75503	358 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SPCS3	P61009	180 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	STPG3	Q8N7X2	389 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4X1	Q8NH49	305 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	OR52E5	Q8NH55	327 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR146	Q96CH1	333 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	GINS3	Q9BRX5	216 aa		8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	DISC1	C4P0D8	188 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	DFFB	O76075	338 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	AKAIN1	P0CW23	69 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CRYBB3	P26998	211 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMBIM6	P55061	237 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM187	Q14656	261 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	CACNG5	Q9UF02	275 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		8.78	□□□□□ -1
PTPRF-211	ENST00000467464		H3BMQ9	156 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	CD5	P06127	495 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	OPRK1	P41145	380 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	DHODH	Q02127	395 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	PMS2P11	Q13670	270 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	IL18	Q14116	193 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	C2orf83	Q53S99	150 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	CSTL1	Q9H114	145 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	PRR13	Q9NZ81	148 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464		U3KQE9	123 aa		8.77	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	NXPH3	O95157	252 aa		8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLC1	P0CG04	106 aa		8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	HTR2B	P41595	481 aa		8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	TIGIT	Q495A1	244 aa		8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	NMS	Q5H8A3	153 aa		8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	IL22RA2	Q969J5	263 aa		8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	PRRT1	Q99946	306 aa		8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	ENY2	Q9NPA8	101 aa		8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		8.76	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	CXorf65	A6NEN9	183 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	NUPR2	A6NF83	97 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	MPTX1	A8MV57	137 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464		K7EQG2	157 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	TNFSF8	P32971	234 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	RND2	P52198	227 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFB131A	P59861	70 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	LEMD1	Q68G75	181 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	DCANP1	Q8TF63	244 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	TRIM63	Q969Q1	353 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	8.75	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	NPPC	P23582	126 aa		8.74	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	P2RY1	P47900	373 aa		8.74	□□□□□ -1.01
PTPRF-211	ENST00000467464	PAFAH1B2	P68402	229 aa		8.74	□□□□□ -1.01

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