RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 C15orf62A8K5M9 175 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 A8MZ25 164 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 K7EMT4 169 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 YIF1AO95070 293 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 CD81P60033 236 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD55Q3KP44 614 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf83Q53S99 150 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.13□□□□□ -0.63
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SH3BP1-205ENST00000466097 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.13□□□□□ -0.63
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SH3BP1-205ENST00000466097 NPY1RP25929 384 aa11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP1-205ENST00000466097 GINS3Q9BRX5 216 aa11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP1-205ENST00000466097 TUBA4BQ9H853 241 aa11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.11□□□□□ -0.63
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SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A4P12235 298 aa11.11□□□□□ -0.63
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SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.11□□□□□ -0.63
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SH3BP1-205ENST00000466097 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 C9orf170A2RU37 121 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 A6NHS1 94 aa11.1□□□□□ -0.63
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SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-205ENST00000466097 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-205ENST00000466097 BATF3Q9NR55 127 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4C46A6NHA9 309 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-205ENST00000466097 CHEK1O14757 476 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-205ENST00000466097 SYNGR2O43760 224 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-205ENST00000466097 CD5P06127 495 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP1-205ENST00000466097 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
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