RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638		J3QR06	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	CHST1	O43916	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	CRLF1	O75462	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	APOC3	P02656	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD34	P28906	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	DGCR2	P98153	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2F1	Q13607	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	MORN2	Q502X0	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZS49	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	P2RX4	Q99571	388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	POLQ	O75417	2590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ECHDC1-208	ENST00000436638	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1B0GUS0	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	CHEK1	O14757	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	PMP2	P02689	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	BRS3	P32247	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SAA4	P35542	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	LOXL3	P58215	753 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAS2R19	P59542	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	HERV-K104	P61576	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	RHOB	P62745	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNMT	Q14749	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZPA2	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	APC	P25054	2843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638		E5RGE8	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638		M0QYG6	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ECHDC1-208	ENST00000436638	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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