RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.83□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 IGLC7A0M8Q6 106 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SSX5O60225 188 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SNAPC5O75971 98 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 CD74P04233 296 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 GPR183P32249 361 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 BMI1P35226 326 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R46P59540 309 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN5P62079 268 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR2C3Q8N628 320 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR1L6Q8NGR2 347 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 HYLS1Q96M11 299 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 M0QYG6 137 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ATP6V1G1O75348 118 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 FCER2P06734 321 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SULT1A3P0DMM9 295 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SULT1A4P0DMN0 295 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA3P12429 323 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 RPA2P15927 270 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-GP17693 338 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 DTYMKP23919 212 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 MAS1LP35410 378 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR2B8PP59922 312 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 FCN2Q15485 313 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 C4orf46Q504U0 113 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR4A47Q6IF82 309 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ARRDC1Q8N5I2 433 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR4S2Q8NH73 311 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 FLVCR2Q9UPI3 526 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN4O14817 238 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TNFSF12O43508 249 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 PMP2P02689 132 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 HRH1P35367 487 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 MFAP2P55001 183 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 APOC4P55056 127 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ARPC4P59998 168 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 RPL8P62917 257 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 HOGA1Q86XE5 327 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 GVQW1Q8N7I0 195 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 STPG3Q8N7X2 389 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 BEST4Q8NFU0 473 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR10W1Q8NGF6 305 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR5B3Q8NH48 314 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TERB2Q8NHR7 220 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 MARC2Q969Z3 335 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 CHRDL1Q9BU40 450 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 BET1LQ9NYM9 111 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR2T8A6NH00 312 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 UPK2O00526 184 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2CO00762 179 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TGOLN2O43493 480 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 DEFA4P12838 97 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 C4BPBP20851 252 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R31P59538 309 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 TMED4Q7Z7H5 227 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 OR5AP2Q8NGF4 316 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXD8-202ENST00000429017 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms