RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BEST4Q8NFU0 473 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSX5O60225 188 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCGB2A1O75556 95 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HLA-DRB4P13762 266 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LPAR6P43657 344 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HBE1P02100 147 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC32Q5I0X7 151 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM17Q86X19 198 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FCAMRQ8WWV6 532 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM230Q96A57 120 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYCBP2O75592 4640 aa11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DBX1A6NMT0 343 aa11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RLN1P04808 185 aa11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB3BP20337 219 aa11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYL9P24844 172 aa11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRCDQ00LT1 54 aa11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa11.61□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTHLHP12272 177 aa11.6□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP5CP53041 499 aa11.6□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HERV-K104P61576 105 aa11.6□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOGA1Q86XE5 327 aa11.6□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCN3BQ9NY72 215 aa11.6□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 J3QL48 77 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CORTO00230 105 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUDT3O95989 172 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RRN3P1Q2M238 152 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4A16Q8NH70 328 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLMPQ8WWB7 406 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRN1Q9NPD7 142 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 U3KQE9 123 aa11.59□□□□□ -0.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLN5O75503 358 aa11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNCAP37840 140 aa11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XGP55808 180 aa11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q9H8V8 135 aa11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.58□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FXYD7P58549 80 aa11.57□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MGLLQ99685 303 aa11.57□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.56□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV3-20P01619 116 aa11.56□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLINT1Q14677 625 aa11.56□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.56□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.56□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4X1Q8NH49 305 aa11.56□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q9H3A6 140 aa11.56□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PPQ1 181 aa11.55□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LYRM9A8MSI8 78 aa11.55□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSX7Q7RTT5 188 aa11.55□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF709Q8N972 641 aa11.55□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F5H768 121 aa11.54□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.54□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.54□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.54□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.54□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.54□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV1-17P01599 117 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OPRK1P41145 380 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBX5P45973 191 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q8WTZ3 238 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC22AQ96IW7 307 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCPEP1Q9HB40 452 aa11.53□□□□□ -0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOTOA8MTQ0 251 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM229AH3BQW9 127 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR31O00270 319 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EREGO14944 169 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGS10O43665 173 aa11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100GP29377 79 aa11.52□□□□□ -0.57
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