RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV1-40P01703 118 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-48P01763 117 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAMTQ14353 236 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLK9Q2XQG4 91 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSM6Q6P461 480 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM223AQ8IWN6 122 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4F5Q8NH21 305 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLK9Q9UKQ9 250 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM89A2RUT3 159 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 K7EIM0 57 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 VWC2Q2TAL6 325 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXorf58Q96LI9 332 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYTL1Q9NRR1 136 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5G2Q06055 141 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 C15orf32Q32M92 178 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCARB1Q8WTV0 552 aa21.41■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB9AP51151 201 aa21.39■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFAP4P55083 255 aa21.39■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFA5Q01523 94 aa21.39■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXE3Q13461 319 aa21.39■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM144Q7Z5S9 345 aa21.39■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0G2JLM5 398 aa21.39■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHDC1Q8N7A1 406 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01006Q8NI28 216 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 C21orf62Q9NYP8 219 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMB8P28062 276 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPBWR1P48145 328 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTNL8Q6UX41 500 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM116Q8NCL8 245 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4X1Q8NH49 305 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLK15Q9H2R5 256 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR83OSQ9Y284 106 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 S4R3C0 116 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFSD2BA6NFX1 497 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPDU1O75352 247 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q56UQ5 140 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf99Q6UWK7 81 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF709Q8N972 641 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa21.37■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SCGB2A1O75556 95 aa21.36■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa21.35■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-23P01764 117 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST8SIA2Q92186 375 aa21.35■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LCNL1Q6ZST4 164 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF114Q9Y508 228 aa21.34■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf112F2Z3M2 114 aa21.34■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10J1P30954 320 aa21.33■■□□□ 1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF502Q8TBZ5 544 aa21.33■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 THAP8Q8NA92 274 aa21.32■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPCDR1Q9BY65 106 aa21.32■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARV1Q9H2C2 271 aa21.32■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MGST2Q99735 147 aa21.31■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNIP2Q9NS61 270 aa21.31■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GUS0 222 aa21.3■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGPAT2O15120 278 aa21.3■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 RSG1Q9BU20 258 aa21.3■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A32Q9H2D1 315 aa21.3■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T8A6NH00 312 aa21.29■■□□□ 1
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-11P01762 117 aa21.29■■□□□ 1
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