RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 RFNGQ9Y644 331 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 NUDT3O95989 172 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 GPX1P07203 203 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 STAG3L2P0CL84 134 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 STAG3L3P0CL85 134 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 MED13LQ71F56 2210 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 A0A1B0GV90 55 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 M0R3E3 92 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 TEX38Q6PEX7 206 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 TCF23Q7RTU1 214 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 ARPC1AQ92747 370 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 KCNS1Q96KK3 526 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 HIGD1CA8MV81 97 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 SERF1AO75920 110 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 CTAG1AP78358 180 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 HERPUD1Q15011 391 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 GAGE10A6NGK3 116 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 SYT8Q8NBV8 401 aa14.59□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.58□□□□□ -0.07
SCARB2-201ENST00000264896 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.072e-8■■■□□ 17.7
SCARB2-201ENST00000264896 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 CXCL1P09341 107 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 CD177Q8N6Q3 437 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 PLXNA2O75051 1894 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 METRNQ9UJH8 293 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 NBR2O15453 112 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 IGHV3-23P01764 117 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 PYYP10082 97 aa14.58□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 Q6AWC8 147 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 TRGV3P03979 118 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 COTL1Q14019 142 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 C1QL4Q86Z23 238 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 EPDR1Q9UM22 224 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 GPR183P32249 361 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 PRELID3AQ96N28 172 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 OTORQ9NRC9 128 aa14.57□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 COX6B1P14854 86 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 GCSHP23434 173 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 COQ2Q96H96 371 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0G2JRQ6 117 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 Q6ZRM9 215 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 A6NJY4 79 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 ADMP35318 185 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 TNFRSF14Q92956 283 aa14.56□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 A0A1B0GW15 77 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 GNG5P63218 68 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 NRN1Q9NPD7 142 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 LYNX1P0DP58 116 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 FABP2P12104 132 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 C14orf144Q96I85 54 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 LINC00473A8K010 186 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 IGHG3P01860 377 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 ADCYAP1P18509 176 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 KLK15Q9H2R5 256 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 MLNRO43193 412 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 CHODLQ9H9P2 273 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 RNF125Q96EQ8 232 aa14.54□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 LEMD1Q68G75 181 aa14.53□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 LINC01551Q86U37 167 aa14.53□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 DDB2Q92466 427 aa14.53□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 C7orf71A4D174 169 aa14.53□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.53□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 PROK2Q9HC23 129 aa14.53□□□□□ -0.08
SCARB2-201ENST00000264896 MST1LQ2TV78 715 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms