RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262395.9

TRAF4-201, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF4, Length 2,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-201ENST00000262395 UPK2O00526 184 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 IGLV1-44P01699 117 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 PRNDQ9UKY0 176 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 CACNA1GO43497 2377 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 TAS2R45P59539 299 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 PMCHL1Q16048 86 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 CR1LQ2VPA4 569 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 IZUMO1RA6ND01 250 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 M0QZ24 198 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 WT1P19544 449 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 MGAQ8IWI9 3026 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 HSBP1O75506 76 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 ERASQ7Z444 233 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 STUMQ69YW2 141 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 NUP35Q8NFH5 326 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 NUDT11Q96G61 164 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 PROCRQ9UNN8 238 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 H3BTX0 84 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 M0R2Z0 102 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 MZT1Q08AG7 82 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 BLNKQ8WV28 456 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 RNF24Q9Y225 148 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAF4-201ENST00000262395 KALRNO60229 2985 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 A0A1W2PRE2 83 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 REG1AP05451 166 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 COX7A2P2O60397 106 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 CD69Q07108 199 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 RTL8BQ17RB0 113 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 NPIPB3Q92617 1050 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 CBY3A6NI87 242 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 IGHG3P01860 377 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 APELAP0DMC3 54 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 S100A7P31151 101 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 LHBP01229 141 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 HARBI1Q96MB7 349 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 HIGD1CA8MV81 97 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 PRR33A8MZF0 331 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 VWC2LB2RUY7 222 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 TSPOP30536 169 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 C2orf83Q53S99 150 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 TCF24Q7RTU0 167 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 PAXXQ9BUH6 204 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 DKK4Q9UBT3 224 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 DYSFO75923 2080 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 PATE2Q6UY27 113 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 SELENOVP59797 346 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 GAFA1Q96PS6 74 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 ITGB1BP1O14713 200 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 CCL3L1P16619 93 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 TBR1Q16650 682 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF329Q86UD4 541 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms