RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 A0A087WUU8 490 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 SLC17A3O00476 420 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 IFI30P13284 250 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 GNG5P63218 68 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 AMTNQ6UX39 209 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 C16orf95Q9H693 158 aa3.62□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.62□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 SIGLEC16A6NMB1 481 aa3.61□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa3.61□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.61□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.61□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.61□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 TANC1Q9C0D5 1861 aa3.6□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.6□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 IGSF23A1L1A6 192 aa3.6□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 Q6ZQT7 251 aa3.6□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 C12orf29Q8N999 325 aa3.6□□□□□ -1.83
MDM2-201ENST00000258148 FNDC9Q8TBE3 224 aa3.6□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.59□□□□□ -1.83
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MDM2-201ENST00000258148 PTPRSQ13332 1948 aa3.58□□□□□ -1.84
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MDM2-201ENST00000258148 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
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MDM2-201ENST00000258148 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.58□□□□□ -1.84
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MDM2-201ENST00000258148 TOMM6Q96B49 74 aa3.57□□□□□ -1.84
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MDM2-201ENST00000258148 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.57□□□□□ -1.84
MDM2-201ENST00000258148 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.57□□□□□ -1.84
MDM2-201ENST00000258148 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa3.57□□□□□ -1.84
MDM2-201ENST00000258148 SCN1AP35498 2009 aa3.56□□□□□ -1.84
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