RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TAS2R46P59540 309 aa11.85□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 MSMO1Q15800 293 aa11.85□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.85□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 SSX9Q7RTT3 188 aa11.85□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.85□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.85□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 TNFSF12O43508 249 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 RLN1P04808 185 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 NAT1P18440 290 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PSMB6P28072 239 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM187Q14656 261 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 HOGA1Q86XE5 327 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 BEST4Q8NFU0 473 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 GIMAP1Q8WWP7 306 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 BET1LQ9NYM9 111 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.84□□□□□ -0.51
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 C7orf66A4D0T2 115 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD2BA6NFX1 497 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SSNA1O43805 119 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PPYP01298 95 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 IFNA10P01566 189 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 IL5P05113 134 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN5P62079 268 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 OR4D10Q8NGI6 311 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.83□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0B4J293 547 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 IGLC7A0M8Q6 106 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 HRASP01112 189 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PMP2P02689 132 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 REG1AP05451 166 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 HLA-GP17693 338 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 FCGR2CP31995 323 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 HRH1P35367 487 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 OR2B8PP59922 312 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ARPC4P59998 168 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 POU2AF1Q16633 256 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.82□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.81□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.81□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.81□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.81□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.81□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.81□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 C15orf61A6NNL5 157 aa11.8□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.8□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf74Q32Q52 190 aa11.8□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.8□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.8□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.8□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CELA1Q9UNI1 258 aa11.8□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 MIFP14174 115 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TAS2R31P59538 309 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 FXYD4P59646 89 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP69Q49AA0 526 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 C4orf46Q504U0 113 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 OR6F1Q8NGZ6 308 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 C18orf15Q96N68 181 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 EHFQ9NZC4 300 aa11.79□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 UPK2O00526 184 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 IFNA21P01568 189 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 IFNA17P01571 189 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC3BP05452 202 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 FGF2P09038 288 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 NQO2P16083 231 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 GPR183P32249 361 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CATR1Q13166 79 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF767PQ75MW2 155 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 OR51H1Q8NH63 302 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TERB2Q8NHR7 220 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf58Q96LI9 332 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms