RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 HIST3H2BBQ8N257 126 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 OR2K2Q8NGT1 345 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 CACNG8Q8WXS5 425 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 J3QRE1 110 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 ORAOV1Q8WV07 137 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 PRDM6Q9NQX0 595 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 PRR32B1ATL7 298 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 PATJQ8NI35 1801 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa17.88■□□□□ 0.45
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PTPRM-211ENST00000580170 IMMP1LQ96LU5 166 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 SCN2AQ99250 2005 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 WBP1Q96G27 269 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00312Q9Y6C7 94 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 HIGD1CA8MV81 97 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GW15 77 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA3O95167 84 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 GNG5P63218 68 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC19AQ6UXS0 136 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 UMODP07911 640 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 SFTA2Q6UW10 78 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
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PTPRM-211ENST00000580170 F8VWA3 439 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 H7C1H1 209 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 EFEMP2O95967 443 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 VWCEQ96DN2 955 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 RAMP3O60896 148 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 UPK2O00526 184 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 TNFSF13O75888 250 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 C1QTNF9P0C862 333 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 CCL1P22362 96 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A0A6YYD4 124 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 CD55P08174 381 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF497Q6ZNH5 498 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 Q6AWC8 147 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM101Q96IK0 257 aa17.85■□□□□ 0.45
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PTPRM-211ENST00000580170 COLCA2A8K830 154 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 H0YIZ8 118 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 FGF16O43320 207 aa17.85■□□□□ 0.45
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PTPRM-211ENST00000580170 GFI1BQ5VTD9 330 aa17.85■□□□□ 0.45
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PTPRM-211ENST00000580170 GDF15Q99988 308 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 WFDC1Q9HC57 220 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA5BQ9P283 1151 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM144Q7Z5S9 345 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf106Q8NAJ2 232 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 C15orf61A6NNL5 157 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00271P0C7V0 271 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 PSME4Q14997 1843 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 TFF1P04155 84 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 FAM57AQ8TBR7 257 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 AMBPP02760 352 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 YPEL1O60688 119 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 OR5AN1Q8NGI8 311 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 YPEL2Q96QA6 119 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRM-211ENST00000580170 LEPP41159 167 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-39P01824 125 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 CEACAM1P13688 526 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 CCL3L1P16619 93 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 SEC11AP67812 179 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 CCL20P78556 96 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf88Q9BSF0 95 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 DUX3Q96PT4 197 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 CYSLTR1Q9Y271 337 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 SCN8AQ9UQD0 1980 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf100A8MU93 164 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 MORN2Q502X0 79 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 SAMD5Q5TGI4 173 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 FAM89BQ8N5H3 189 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 MPZP25189 248 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF585BQ52M93 769 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF319Q9P2F9 582 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 TAF1LQ8IZX4 1826 aa17.81■□□□□ 0.44
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