RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC35B3Q9H1N7 401 aa22.7■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 YIF1AO95070 293 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 KHDC3LQ587J8 217 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 TEX22C9J3V5 150 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPT1P50897 306 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 GUCA2BQ16661 112 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM249Q2WGJ8 235 aa22.68■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PRR20CP86479 221 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRR20DP86480 221 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRR20BP86481 221 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRR20AP86496 221 aa22.68■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A22Q9H936 323 aa22.66■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C5orf64Q2M2E5 130 aa22.65■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC35E1Q96K37 410 aa22.65■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCA2Q9BZC7 2435 aa22.64■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PAX6P26367 422 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-210ENST00000574322 STPG3Q8N7X2 389 aa22.64■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC168Q8NDH2 2452 aa22.63■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TSPAN9O75954 239 aa22.6■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PIP4P2Q8N4L2 257 aa22.6■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-210ENST00000574322 VAX2Q9UIW0 290 aa22.6■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM11P17152 192 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-210ENST00000574322 BTN1A1Q13410 526 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-210ENST00000574322 SOHLH1Q5JUK2 328 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC35E3Q7Z769 313 aa22.58■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MANBALQ9NQG1 85 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa22.57■■□□□ 1.2
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