RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	ATP6V0B	Q99437	205 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		15.72	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	MT-CO2	P00403	227 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	IFNA17	P01571	189 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	CTSG	P08311	255 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	TMEM187	Q14656	261 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	SLC35G3	Q8N808	338 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	GPR146	Q96CH1	333 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		15.71	■□□□□ 0.11
CS-222	ENST00000550996	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	CD7	P09564	240 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	S100A5	P33763	92 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	DHODH	Q02127	395 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996		Q56UQ5	140 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	BTNL8	Q6UX41	500 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	GALNT14	Q96FL9	552 aa		15.7	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	FAM219A	Q8IW50	185 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	CACNG5	Q9UF02	275 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	NDUFA4	O00483	81 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	CD81	P60033	236 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	GUCA2B	Q16661	112 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	NEURL2	Q9BR09	285 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	SRR	Q9GZT4	340 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	PALMD	Q9NP74	551 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	AKR1C4	P17516	323 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	MFAP4	P55083	255 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	BSX	Q3C1V8	233 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	MARC2	Q969Z3	335 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	SNCA	P37840	140 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	AP3S2	P59780	193 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	SPCS3	P61009	180 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	IL22RA2	Q969J5	263 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	RCHY1	Q96PM5	261 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	NMS	Q5H8A3	153 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	DEFB125	Q8N687	156 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	OR52E5	Q8NH55	327 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	TXN2	Q99757	166 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	15.65	■□□□□ 0.1
CS-222	ENST00000550996	NXPH3	O95157	252 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	BAK1	Q16611	211 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	MLANA	Q16655	118 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	HAGH	Q16775	308 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	TUBA4B	Q9H853	241 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	ENY2	Q9NPA8	101 aa		15.63	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996		A0A0B4J2A0	478 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	C15orf62	A8K5M9	175 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	OR11H12	B2RN74	326 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996		K7EMT4	169 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	OR10C1	Q96KK4	312 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		15.62	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	GNG7	O60262	68 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		15.61	■□□□□ 0.09
CS-222	ENST00000550996	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		15.61	■□□□□ 0.09

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