RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C15orf62A8K5M9 175 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPAN4O14817 238 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFNA17P01571 189 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNCAP37840 140 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDCD10Q9BUL8 212 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBQLN2Q9UHD9 624 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0B4J293 547 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL17DQ8TAD2 202 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ST8SIA3O43173 380 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNG7O60262 68 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MEF2DQ14814 521 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DIRAS2Q96HU8 199 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMPXQ9UHP9 88 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 P0C879 139 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL18Q14116 193 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAAP20Q6NZ36 180 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB2BQ8WUD1 216 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ENY2Q9NPA8 101 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR4C46A6NHA9 309 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DISC1C4P0D8 188 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 B3GALNT1O75752 331 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UCP1P25874 307 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ETV6P41212 452 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM116Q8NCL8 245 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUSP18Q8NEJ0 188 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMIM4Q8WVI0 70 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCE6AA0A183 80 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPBWR1P48145 328 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHEK1O14757 476 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKAIN1P0CW23 69 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMBIM6P55061 237 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF414Q96IQ9 312 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR10C1Q96KK4 312 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF2Q99496 336 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OVOL2Q9BRP0 275 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RABL2BQ9UNT1 228 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0G2JRQ6 117 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INS-IGF2F8WCM5 200 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR5AC1P0C628 307 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APOC4P55056 127 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCL7BQ9BQE9 202 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM222Q9H0R3 208 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CORTO00230 105 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTDSPLO15194 276 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOL3O60936 208 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TFPI2P48307 235 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ODF3L2Q3SX64 289 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR4C16Q8NGL9 310 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GINS3Q9BRX5 216 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAA60Q9H7X0 242 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDS2O95674 445 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOMM20LQ6UXN7 152 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM219AQ8IW50 185 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLYATL2Q8WU03 294 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CSMD3Q7Z407 3707 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM50AO95807 157 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHODHQ02127 395 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q6ZRM9 215 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRRT1Q99946 306 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR132Q9UNW8 380 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBE2CO00762 179 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BMI1P35226 326 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OPRK1P41145 380 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL5P46777 297 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPCS3P61009 180 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PVRIGQ6DKI7 326 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF600Q6ZNG1 722 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GBGT1Q8N5D6 347 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STPG3Q8N7X2 389 aa17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms