RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 PRTN3P24158 256 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 EFNA4P52798 201 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 PSG5Q15238 335 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 ODF3BA8MYP8 253 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 B4DEV8 164 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00869P0C866 280 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 CNTFRP26992 372 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 HTR1DP28221 377 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 MAS1LP35410 378 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS8Q16651 343 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 HCP5Q6MZN7 132 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 PAGE4O60829 102 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 CXorf1O96002 111 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 RHOBP62745 196 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 MLANAQ16655 118 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF114Q8NC26 417 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 ISOC2Q96AB3 205 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 DPM3Q9P2X0 92 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF727A8MUV8 499 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 OVOL3O00110 214 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 ACTL6BO94805 426 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV2-5P01817 119 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 MT-ND4LP03901 98 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 FOLR2P14207 255 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 CEACAM3P40198 252 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 OR4F5Q8NH21 305 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SLC35E1Q96K37 410 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 OR4F4Q96R69 305 aa6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 TIMM23O14925 209 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 CRYBA1P05813 215 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 OR10J1P30954 320 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 KLRD1Q13241 179 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 TNXAQ16473 311 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 RNF212Q495C1 297 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 NANPQ8TBE9 248 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 CFHR4Q92496 578 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 YPEL4Q96NS1 127 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf94C9JXX5 98 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 VENTXO95231 258 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 OR2C1O95371 312 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 PAX2Q02962 417 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 PARLQ9H300 379 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 MLXQ9UH92 298 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 NAT8Q9UHE5 227 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 CXorf65A6NEN9 183 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 PDE6DO43924 150 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 SIRPDQ9H106 197 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 FBXL15Q9H469 300 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 FUT9Q9Y231 359 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 VPS13CQ709C8 3753 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 TEX22C9J3V5 150 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 MT-CO2P00403 227 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 REG1AP05451 166 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 CRYGCP07315 174 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 OR5G3P0C626 314 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.5 ms