RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 AQP10Q96PS8 301 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 STAB1Q9NY15 2570 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 IGSF23A1L1A6 192 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF222A6NCQ9 220 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM223BA6NKX1 122 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 HMSDA8MTL9 139 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 F8W735 103 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 H3BP45 60 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 SMLR1H3BR10 107 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 I3L2K1 104 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 C1QBP02746 253 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF329Q86UD4 541 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 NECAP1Q8NC96 275 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 OR5T1Q8NG75 326 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP6V0BQ99437 205 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 CITED1Q99966 193 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 KLK15Q9H2R5 256 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 ENY2Q9NPA8 101 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 NUDT19A8MXV4 375 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 FNDC10F2Z333 226 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 CORTO00230 105 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 PRH1P02810 166 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 PF4V1P10720 104 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 CD28P10747 220 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 SNCAP37840 140 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 SULT1A1P50225 295 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 BAXQ07812 192 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 ARL16Q0P5N6 197 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 VWC2Q2TAL6 325 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 NOXA1Q86UR1 476 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 PSENENQ9NZ42 101 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A0G2JLM5 398 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 L7N2F9 121 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFB8O95169 186 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 IFNA10P01566 189 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 RLN2P04090 185 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFA4P12838 97 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB9AP51151 201 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 CAV2P51636 162 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 TPPP2P59282 170 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP10-3P60369 221 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 VAMP2P63027 116 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 RHOGP84095 191 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 CD69Q07108 199 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF345Q14585 488 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 THAP6Q8TBB0 222 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 USMG5Q96IX5 58 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC140Q96MF4 163 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 GGACTQ9BVM4 153 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 DNHD1Q96M86 4753 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1W2PRX2 142 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2J3O76001 311 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 MT-CO2P00403 227 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 TRGV3P03979 118 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 OR8U8P0C7N1 319 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB11AP62491 216 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 DLK1P80370 383 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-207ENST00000454947 RUNX1Q01196 453 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms