RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 MISP3Q96FF7 219 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 MLXQ9UH92 298 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 A8MWP6 167 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 CTSGP08311 255 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 BTCP35070 178 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 AP3S2P59780 193 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 MLANAQ16655 118 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 Q56UQ5 140 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 NMSQ5H8A3 153 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 FAM219AQ8IW50 185 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 OR52E5Q8NH55 327 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.1□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 CYB5BO43169 146 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 C8orf88P0DMB2 117 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SPCS3P61009 180 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1R1AQ13522 171 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 BSXQ3C1V8 233 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 IL22RA2Q969J5 263 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.09□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0B4J2A0 478 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 A6NHS1 94 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 CD7P09564 240 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 IL7P13232 177 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TRIQKQ629K1 86 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 LCN12Q6JVE5 192 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 BTNL8Q6UX41 500 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 ATP6V0BQ99437 205 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.08□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFA4O00483 81 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 PLA2G10O15496 165 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SFT2D2O95562 160 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SNCAP37840 140 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 MFAP4P55083 255 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 LGI3Q8N145 548 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 A8MZ25 164 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 PITX3O75364 302 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFB6O95139 128 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 ANXA3P12429 323 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 VAMP1P23763 118 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TNFRSF9Q07011 255 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SMCO1Q147U7 214 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 GUCA2BQ16661 112 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 LRTM2Q8N967 370 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TXN2Q99757 166 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 RBKSQ9H477 322 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 PALMDQ9NP74 551 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 ENY2Q9NPA8 101 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TENM3Q9P273 2699 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.5 ms